Jehovini svjedoci u Kirgistanu djeluju od 1956, a zakonski su registrirani 1998. Iako im je u prošlosti sloboda vjeroispovijedi bila ozbiljno ugrožena, država u posljednje vrijeme sve više štiti njihova prava.

U studenome 2013. Ustavno vijeće Vrhovnog suda u Kirgistanu jednoglasnom je odlukom neustavnim proglasilo postojeći Zakon o civilnoj službi i naložilo vladi da u njega unese izmjene. Kirgistanski sudovi uvažili su odluku Ustavnog vijeća, pa se od 2014. Jehovine svjedoke više kazneno ne goni zato što odbijaju ići u vojsku. Dana 29. lipnja 2015. Kirgistan je izmijenio Zakon o vojnoj službi kako bi osobama koje ulažu prigovor savjesti omogućio obavljanje civilne službe koja nije u nadležnosti vojske.

U rujnu 2014. Ustavno vijeće Vrhovnog suda presudilo je u korist Jehovinih svjedoka i time zaštitilo slobodu vjeroispovijedi jer je neke dijelove Zakona o vjerskim zajednicama (2008) proglasilo neustavnima. Međutim, Državno povjerenstvo za vjerska pitanja oglušilo se na odluku Vijeća i još uvijek ne želi registrirati Jehovine svjedoke na jugu zemlje. Budući da Jehovini svjedoci ondje nisu registrirani, vlasti u nekim gradovima njihove aktivnosti smatraju protuzakonitima. No nakon što se Jehovini svjedoci sastanu s vlastima kako bi se nesporazum riješio, obično im se omogući da se u miru sastaju te da bez ometanja bližnjima prenose svoja vjerska uvjerenja. Jehovini svjedoci nadaju se da će vlasti u potpunosti usvojiti odluku Ustavnog vijeća te ih registrirati i na jugu Kirgistana.