Свидетели Иеговы появились в Киргизии в 1956 году. В 1998 году они были официально зарегистрированы. Хотя в прошлом их свобода вероисповедания существенно ущемлялась, в последнее время государство стало защищать их права.

В ноябре 2013 года Конституционная палата Верховного суда Киргизской Республики единогласно постановила, что закон страны об альтернативной службе противоречит Конституции и нуждается в поправках. Киргизские суды применили решение Конституционной палаты, и с начала 2014 года мужчин-Свидетелей больше не привлекают к суду за отказ от военной службы. 29 июня 2015 года Киргизия внесла поправки в закон о военной службе, предоставив тем, кто отказывается от нее по убеждениям, возможность проходить альтернативную гражданскую службу, которая не находится в ведении военных структур.

В сентябре 2014 года Конституционная палата Верховного суда вынесла решение в пользу Свидетелей Иеговы и религиозной свободы, объявив, что части закона о религии, принятого в 2008 году, противоречат Конституции. Однако Государственная комиссия по делам религий проигнорировала решение Верховного суда и отказалась зарегистрировать местные религиозные организации Свидетелей в южных регионах страны. Из-за отсутствия регистрации некоторые органы власти считали деятельность Свидетелей Иеговы незаконной. Тем не менее практика показывает, что когда Свидетелям удается встретиться с представителями власти и уладить недопонимание, то им, как правило, разрешается беспрепятственно собираться для поклонения и делиться своей верой с другими. Свидетели надеются, что правительство в полной мере претворит в жизнь решение Конституционной палаты и зарегистрирует их местные религиозные организации на юге страны.